Caracterização mitogenômica de Elops affinis (Regan, 1909) e as implicações filogenéticas para a família Elopidae

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dc.contributor.advisor1SOUSA, Rodrigo Petry Corrêa de
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/0921857281639788
dc.contributor.advisor1ORCIDhttps://orcid.org/0000-0002-3626-4484
dc.creatorMARCOS , Rebeca Sabrina Cunha
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/5735159759185927
dc.date.accessioned2026-08-06T19:25:34Z
dc.date.available2026-08-06T19:25:34Z
dc.date.issued2026-07-13
dc.description.abstractThe family Elopidae (Elopiformes) represents one of the most basal lineages of teleost fishes and plays an important role in understanding the evolution of modern bony fishes. Despite its wide geographic distribution and ecological importance, this family remains poorly explored from a molecular perspective, limiting robust inferences regarding its systematics, phylogeny, and evolutionary history. Among the species of the genus Elops, Elops affinis is particularly noteworthy due to its restricted distribution in the Eastern Pacific, making it a promising model for mitogenomic and evolutionary studies. In this context, the present study aimed to assemble, characterize, and analyze the complete mitochondrial genome of E. affinis, investigating its gene organization, nucleotide composition, codon usage patterns, and phylogenetic relationships. The mitochondrial genome was obtained through next-generation sequencing (NGS), followed by genome assembly, annotation, and comparative analyses with available mitogenomes from other Elopidae species. The mitogenome comprised 16,712 bp and exhibited the typical vertebrate gene organization, containing 13 protein-coding genes, 22 transfer RNA genes, two ribosomal RNA genes, and a control region, with no evidence of gene rearrangements or tandem repeats. Nucleotide composition analyses revealed an A+T bias over G+C and compositional asymmetry patterns consistent with those reported for other teleost fishes. Codon usage analysis indicated a bias in synonymous codon usage, with leucine and serine being the most abundant amino acids encoded by the mitochondrial genome. Phylogenetic analyses recovered Elops as a monophyletic group within Elopidae and placed E. affinis as the most divergent lineage among the species analyzed. These findings expand the mitogenomic resources available for Elopidae and provide new insights into the systematics, phylogeny, molecular evolution, biogeography, population genetics, and conservation of this group.en
dc.description.resumoA família Elopidae (Elopiformes) representa uma das primeiras linhagens divergentes de teleósteos e desempenha papel importante para a compreensão da evolução dos peixes ósseos modernos. Apesar de sua ampla distribuição geográfica e relevância ecológica, os representantes dessa família ainda permanecem relativamente pouco explorados sob a perspectiva molecular, limitando inferências mais robustas sobre sua sistemática, filogenia e história evolutiva. Entre as espécies do gênero Elops, Elops affinis destaca-se por sua distribuição restrita ao Pacífico Oriental, constituindo um modelo promissor para estudos mitogenômicos e evolutivos. Nesse contexto, o presente estudo teve como objetivo montar, caracterizar e analisar o genoma mitocondrial completo de E. affinis, investigando sua organização gênica, composição nucleotídica, padrões de uso de códons e relações filogenéticas. O genoma mitocondrial foi obtido por sequenciamento de nova geração (NGS), seguido de montagem, anotação e análises comparativas com mitogenomas disponíveis para representantes de Elopidae. O mitogenoma apresentou 16.712 pb e organização gênica típica de vertebrados, contendo 13 genes codificadores de proteínas, 22 genes transportadores de RNA, dois genes ribossomais e uma região controle, sem evidências de rearranjos gênicos ou repetições em tandem. As análises de composição nucleotídica evidenciaram predominância de A+T em relação a G+C e padrões de assimetria composicional compatíveis com os descritos para outros teleósteos. O uso de códons revelou viés na utilização de códons sinônimos, com predominância dos aminoácidos leucina e serina. As análises filogenéticas recuperaram o gênero Elops como um grupo monofilético dentro de Elopidae e posicionaram E. affinis como a linhagem mais divergente entre as espécies analisadas. Os resultados ampliam os recursos mitogenômicos disponíveis para Elopidae e fornecem novas evidências para estudos de sistemática, filogenia, evolução molecular, biogeografia, genética populacional e conservação.pt_BR
dc.identifier.citationMARCOS, Rebeca Sabrina Cunha. Caracterização mitogenômica de Elops affinis (Regan, 1909) e as implicações filogenéticas para a família Elopidae. Orientador: Rodrigo Petry Corrêa de Sousa. 2026. 42 f. Trabalho de Curso (Licenciatura em Ciências Biológicas) – Faculdade de Ciências Biológicas. Instituto de Estudos Costeiros, Campus Universitário de Bragança, Universidade Federal do Pará, Bragança-PA, 2026. Disponível em: https://bdm.ufpa.br/handle/prefix/9860. Acesso em: .pt_BR
dc.identifier.urihttps://bdm.ufpa.br/handle/prefix/9860
dc.rightsAcesso Abertopt_BR
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilen
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
dc.subjectElopiformespt_BR
dc.subjectEspécies cripticaspt_BR
dc.subjectFilogenia molecularpt_BR
dc.subjectGenoma mitocondrialpt_BR
dc.subjectMitogenomapt_BR
dc.subjectElopiformesen
dc.subjectCryptic speciesen
dc.subjectMolecular phylogenyen
dc.subjectMitochondrial genomeen
dc.subjectMitogenomeen
dc.subject.cnpqCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOS
dc.titleCaracterização mitogenômica de Elops affinis (Regan, 1909) e as implicações filogenéticas para a família Elopidaept_BR
dc.typeTrabalho de Curso - Graduação - Monografiapt_BR

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