Navegando por Assunto "COI"
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Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) DNA Barcoding revela diversidade molecular na espécie Eleotris melanosoma Bleeker, 1853 (Eleotridae: gobiiformes)(2026-07-16) GORDO, Vinícius Cunha; COSTA, Aurycéia Jaquelyne Guimarães da; http://lattes.cnpq.br/5342395629825218; SOUZA, Marcelo Nazareno Vallinoto de; http://lattes.cnpq.br/9327173329561099A família Eleotridae compreende peixes anfídromos conhecidos como "sleepers", cuja identificação taxonômica é historicamente complexa devido ao extremo conservadorismo morfológico e à ocorrência de espécies crípticas. O objetivo deste estudo foi diagnosticar o status taxonômico de diferentes populações de Eleotris melanosoma por meio de DNA Barcoding e da delimitação automatizada de espécies. Sequências do gene mitocondrial Citocromo C Oxidase Subunidade I (COI), totalizando um alinhamento de 573 pares de bases (pb) e abrangendo 14 espécies do gênero Eleotris, foram obtidas de bancos de dados públicos e analisadas por meio do método de agrupamento de Neighbor-Joining (K2P) e do algoritmo Automatic Barcode Gap Discovery (ABGD). A análise de distribuição de distâncias genéticas revelou um padrão bimodal marcante, evidenciando um hiato de código de barras (barcode gap) bem definido que estabeleceu um consenso estável de 20 Unidades Taxonômicas Operacionais Moleculares (MOTUs) para o gênero. A topologia filogenética demonstrou que E. melanosoma não compõe um clado homogêneo, dividindo-se em três linhagens geneticamente divergentes e geograficamente estruturadas: a Linhagem 1, correspondente a espécimes da Indonésia e Palau (divergência intraespecífica de 0,43%); a Linhagem 2, que abrange indivíduos da Polinésia Francesa e Ilhas Salomão, apresentando a maior divergência interna (1,3%); e a Linhagem 3, vinculada ao complexo Eleotris diamsoi na região de Madagascar, Mayotte e África do Sul (0,15%). A divergência genética interespecífica par a par (distância p) dentro do complexo atingiu 5,4% entre as Linhagens 1 e 2, e até 7,3% em relação à Linhagem 3, confirmando a existência de espécies crípticas sob o morfotipo clássico de E. melanosoma. Adicionalmente, as análises recuperaram clusters estruturados para Eleotris fusca e mantiveram as sequências de Eleotris perniger agregadas em uma única MOTU, embora sob uma divergência intraespecífica relativamente alta de 1,3%, sugerindo um processo de diferenciação geográfica incipiente ou fluxo gênico residual. Os resultados confirmam a robustez do gene COI combinado ao algoritmo ABGD como ferramentas moleculares fundamentais para refinar hipóteses evolutivas e guiar uma abordagem taxonômica integrativa na família Eleotridae.Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) Marcadores mitocondriais para identificação da diversidade de Anostomidae(2025-03-31) NASCIMENTO, Bruna Gabriele Cardoso; VENEZA, Ivana Barbosa; http://lattes.cnpq.br/4570488200672692; https://orcid.org/0000-0002-3528-1290; GOMES, Grazielle Fernanda Evangelista; http://lattes.cnpq.br/5740656339448561; https://orcid.org/0000-0001-8898-0311A família Anostomidae, composta por peixes de água doce neotropicais, destaca-se pela sua diversidade e importância ecológica e econômica nas áreas onde ocorrem. No entanto, trata-se de um grupo controverso quanto à real diversidade registrada, relações filogenéticas complexas e identificação de espécies problemática. Diante disso, este estudo teve como objetivo investigar a eficiência de fragmentos mitocondriais para determinação de espécies de Anostomidae. Para isso, a pesquisa foi conduzida em dez localidades, onde foram amostrados 127 indivíduos, a partir dos quais foram amplificados fragmentos mitocondriais do gene Citocromo Oxidase C, Subunidade I (COI) e Região Controle (RC). Representantes de haplótipos de ambas as regiões genéticas estudadas foram confrontadas em bancos públicos de sequências, além da aplicação da identificação filogenética, baseada na topologia de cladogramas, auxiliada por identificação morfológica. Os resultados demonstraram que o gene COI apresentou limitações na distinção de espécies a partir das comparações em bancos públicos de sequências, o que foi indicado pela alta similaridade genética entre múltiplas espécies, algo corroborado pela Inferência Bayesiana desse fragmento, onde os clados não demonstraram arranjos indistintos a nível de espécie e gênero. Por outro lado, a análise filogenética baseada na RC revelou uma melhor resolução para a discriminação dos gêneros Leporinus, Megaleporinus e Schizodon, assim como para espécies, em conformidade com a identificação morfológica. No entanto, a escassez de sequências da RC em bancos públicos limitou sua aplicabilidade para identificação molecular de Anostomidae. Assim, o uso desse fragmento mitocondrial mostra-se promissor como alternativa, aliado à morfologia, para aprimorar a identificação e delimitação de anostomídeos, e dessa forma, pode contribuir com estudos taxonômicos e filogenéticos do grupo.